Ген. Очень личная история - Сиддхартха Мукерджи

Докинз Р. Эгоистичный ген. М.: Corpus, 2013.

575

«Я – тоже муха»: Marsh N. William Blake: The Poems. Houndmills, Basingstoke, England: Palgrave, 2001.

576

Блейк У. Муха // Собрание сочинений С. Я. Маршака в восьми томах. Т. 3. М.: Художественная литература, 1969.

577

Льюис изучал мутантов. Многих из этих мутантов получили Бриджес и Стёртевант. Описание деталей строения мутантных мух и генов, повреждаемых при той или иной мутации, можно найти в нобелевской лекции Эдварда Баттса Льюиса (8 декабря 1995 года).

578

Таких мутантов и гены, мутации в которых (или изменения экспрессии) ведут к локальным нарушениям плана тела, называют гомеозисными. У животных многие из этих генов кодируют транскрипционные факторы знаменитого семейства Hox. Гомеозисные гены содержат характерную и очень консервативную (сходную у мухи и человека) последовательность нуклеотидов – гомеобокс, которая кодирует гомеодомен в соответствующем транскрипционном факторе. С помощью этого домена фактор взаимодействует с особыми участками ДНК, чтобы регулировать активность целых генных каскадов.

579

Активность гомеозисных генов подконтрольна транскрипционным факторам высших рангов, которые кодируются этими самыми генами сегментации из групп gap, полярности сегментов и pair-rule, а также белкам, меняющим структуру хроматина.

580

До оплодотворения яйца информация о таких белках обычно хранится в виде мРНК, а трансляция (синтез белка) начинается уже после оплодотворения.

581

Вещества, градиент концентрации которых (формирующийся по мере удаления от источника) поставляет пространственную информацию для построения эмбриона, называют морфогенами. Часть из них работает в пределах одной клетки, часть путешествует из клетки в клетку, а некоторые потенциальные морфогены (ретиноевая кислота, активный метаболит витамина А) просто поступают из среды. У дрозофилы к материнским (кодируемым геномом матери) факторам эмбриогенеза относят, например, морфогены Bicoid (фактор транскрипции) и Nanos (репрессор трансляции). Некоторые морфогены (Decapentaplegic, Wingless) кодируются уже ДНК зародыша.

582

Здесь напрашивается вопрос: как в природе появились первые асимметричные организмы? Мы этого не знаем и, возможно, не узнаем никогда. В какой-то момент эволюционной истории какой-то организм развился до такой степени, что у него разделились функции двух частей тела. Вероятно, один конец его тела контактировал со скалой, другой – с океаном. Этот везучий мутант уродился с чудесной способностью накапливать белок в ротовой части, а не в ножной. Функциональное различение рта и ноги дало мутанту селективное преимущество: каждая отличная от другой часть его тела могла далее специализироваться на выполнении собственных задач, повышая приспособленность организма к среде. Наши головы и хвосты – удачливые наследники того эволюционного новшества. – Прим. автора.

583

«Грех ли делает гусеницу куколкой»: Müller F. M. Memories: A Story of German Love. Chicago: A. C. McClurg, 1902.

584

В классической детской книжке Лео Лионни: Lionni L. Inch by Inch. NY: I. Obolensky, 1960.

585

Вероятно, это отсылка к букероносному роману индийской писательницы Арундати Рой «Бог мелочей».

586

«Мы намереваемся выявить у червя каждую клетку»: Crow J. F., Dove W. F. Perspectives on Genetics: Anecdotal, Historical, and Critical Commentaries, 1987–1998. Madison: University of Wisconsin Press, 2000.

587

«будто пялишься в таз с сотнями виноградин»: из моего интервью с Робертом Хорвицем, 2012 год.

588

«Истории как таковой нет вовсе»: Emerson R. W. The Journals and Miscellaneous Notebooks of Ralph Waldo Emerson (vol. 7) / Gilman W. H. (ed.). Cambridge, MA: Belknap Press of Harvard University Press, 1960.

589

Эмерсон Р., Topo Г. Эссе. Уолден, или Жизнь в лесу. М.: Художественная литература, 1986.

590

131 клетка всегда почему-то исчезала: Yang N., Goping I. S. C. elegans and Discovery of the Caspases // Apoptosis. San Rafael, CA: Morgan & Claypool Life Sciences, 2013.

591

апоптоз: Kerr J. F. R., Wyllie A. H., Currie A. R. Apoptosis: A basic biological phenomenon with wide-ranging implications in tissue kinetics. British Journal of Cancer. 1972; 26 (4): 239.

592

У другого клеточные останки не удалялись. Этого мутанта изначально идентифицировал молекулярный биолог Эдвард Хеджкок (из моего интервью с Робертом Хорвицем, 2013 год).

593

Роль BCL2 в предотвращении клеточной смерти установили австралийские ученые, Дэвид Вокс и Сьюзанн Кори. – Прим. автора.

594

Избыточная экспрессия гена BCL2 опасна тем, что его продукт, в норме не дающий клеткам беспричинно самоликвидироваться, блокирует выход из митохондрий цитохрома С, который инициирует апоптоз. Из-за этого не может собраться апоптотический комплекс и активироваться первый из «очереди» тех самых палачей, протеаз под названием каспазы. Этот биохимический узел настолько важен, что в схемы лечения некоторых лимфом включают блокатор белка Bcl2.

595

Хорвиц и Салстон обнаружили исключительные пары клеток: Sulston J. E., Horvitz H. R. Post-embryonic cell lineages of the nematode, Caenorhabditis elegans. Developmental Biology. 1977; 56 (1): 110–156. См. также Kimble J., Hirsh D. The postembryonic cell lineages of the hermaphrodite and male gonads in Caenorhabditis elegans. Developmental Biology. 1979; 70 (2): 396–417.

596

Речь идет о выборе пути развития соматических клеточных структур половых органов C. elegans: эти структуры различны у гермафродитов и самцов, но их клеточные линии берут начало от одной пары клеток – Z1 и Z4.

597

Но даже такая неопределенность: Kimble J. Alterations in cell lineage following laser ablation of cells in the somatic gonad of Caenorhabditis elegans. Developmental Biology. 1981; 87 (2): 286–300.

598

Бреннер в шутку назвал их британской и американской моделями: Gehring W. J. Master Control Genes in Development and Evolution: The Homeobox Story. New Haven, CT: Yale University Press, 1998.

599

приступила к изучению эффектов острых потрясений. Этот метод первыми освоили Джон Уайт и Джон Салстон (из моего интервью с Робертом Хорвицем, 2013 год).

600

«Каждый